甲醛碳原子以三个sp的平方杂化轨道形成三个键。其中一个是和氧形成一个键。这三个键在同一平面上。碳原子的一个p轨道和氧的一个p轨道彼此重叠起来形成一个派键。与这三个键所成的平面垂直。键角HCH等于111、5度，角HCO等于121、8度。键长CH键是120.3pm，CO键110pm。正负电荷中心不能重合，所以是极性分子。
区分极性分子和非极性分子的方法：
非极性分子的判据：中心原子化合价法和受力分析法。
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